Christophe Guyard naît en 1966 à Rennes. Il se forme d'abord au Conservatoire de région de Rennes, où il étudie le piano avec Pierre Froment, l'orgue avec Catherine Cohen et la composition avec Franz Tournier. C'est dans les années 1980, à l'occasion de concerts donnés à l'Opéra de Rennes, qu'il rencontre Olivier Messiaen : après avoir lu le manuscrit de sa Trilogie 15 pour grand orgue, le maître l'encourage à poursuivre ses études à Paris.
En 1984, Christophe Guyard intègre le Conservatoire national supérieur de musique de Paris (CNSMDP), où il travaille l'analyse avec Jacques Castérède, l'orchestration avec Marius Constant et la composition avec Claude Ballif. Cette formation auprès de figures majeures de la création musicale française de la seconde moitié du XXe siècle façonne durablement son langage.
De 1985 à 1995, il est organiste titulaire de l'abbaye du Mont-Saint-Michel, en Normandie. Cette période nourrit une part importante de son œuvre pour orgue, notamment le recueil L'Office du Mont-Saint-Michel, dont la pièce Laudabo Deum meum, fondée sur le psaume 145. Parallèlement, de la fin des années 1980 au milieu des années 1990, il dirige le Conservatoire d'Albertville, où il compose de nombreuses pièces destinées aux ensembles d'élèves.
Son nom reste associé à plusieurs commandes officielles d'envergure. Pour les Jeux olympiques d'hiver d'Albertville en 1992, il écrit et dirige la Symphonie des Jeux, vaste partition pour chœur, récitant, piano et orchestre, projet conjoint des conservatoires d'Annecy, d'Albertville et de Grenoble, créée par les élèves de ces établissements sous sa direction. Quelques années plus tard, le Conseil de l'Europe lui commande un nouvel arrangement orchestral de l'hymne européen, d'après l'Ode à la joie de Beethoven.
Christophe Guyard a poursuivi une activité de compositeur prolifique, son catalogue couvrant les domaines orchestral, lyrique, de chambre, pour orgue et pour piano, avec plus d'une centaine d'opus. Parmi ses œuvres pour orgue figurent les Quatre Métamorphoses (Fantaisie, Adagio, Esprits, Toccata), qu'il a lui-même interprétées au grand orgue Debierre/Beuchet-Debierre de la cathédrale Saint-Samson de Dol-de-Bretagne.
En 2010, il cofonde avec Marc Lys la Villa des Compositeurs, structure vouée à la diffusion et à la conservation des œuvres de compositeurs vivants. Il s'investit également dans la création de spectacles son et lumière sur des sites patrimoniaux en France et en Suisse, et exerce des responsabilités au sein de fondations musicales, notamment liées à l'héritage d'Igor Stravinsky.